Сложность и многоаспектность кризисной ситуации, сложившейся в финансово-экономической плоскости развития Российской Федерации в 2014-2016 годах, подталкивает кардинально пересмотреть свои рыночные позиции практически всех без исключения существующих там субъектов, вынуждая их оптимизировать имеющиеся в распоряжении ресурсы. Не являются исключением здесь и предприятия агропромышленного комплекса (далее - агропромышленные предприятия), эффективность деятельности которых в наибольшей степени зависит от направления динамики изменения разноплановых индикаторов рынка. Так, согласно исследованиям, проведенным компанией Ernst&Young, относительная эффективность деятельности исследуемых предприятий в Российской Федерации по итогам 2015 года снизилась на 3,25% [9].Согласно сложившейся в последнее время в научной среде парадигме для нивелирования воздействия последствий кризисных явлений многие отечественные [1, 2, 3] и зарубежные [6, 8] исследователи предлагают применять институт модернизации, поле деятельности которого затрагивает важнейшие процессы функционирования предприятий - от производственной составляющей до управления персоналом [4]. Как было выяснено, процесс применения института модернизации в предприятиях агропромышленного комплекса Российской Федерации в рамках реализации целого ряда инновационных проектов в 2015 году был сопряжен с целым рядом проблем, значимая часть которых затронула сферу управления их деятельностью, в частности, вопросами управления стимулированием инновационной деятельности [10]. Ввиду этого, в данной публикации будет исследован вопрос модернизации управления стимулированием инновационной деятельности на предприятиях агропромышленного комплекса. Условия, материалы и методы исследования. В целях локализации исследования среди предприятий агропромышленного комплекса были выбраны субъекты, осуществляющие свою деятельность в рамках раздела «А» общероссийского классификатора видов экономической деятельности «Сельское, лесное хозяйство, охота, рыболовство и рыбоводство» [5].Территориальной привязкой исследования выступила Республика Татарстан с временным периодом с 2013 по 2015 годы. Основными объектами исследования здесь выступили следующие агропромышленные предприятия: ОАО «Красный Восток Агро»  и ЗАО «Агросила Групп» [10, 11].Для проведения исследования были использованы следующие методы: аналитический, графический, экспертный, экономико-математический, логический и системный подход.Основной акцент в проведенном исследовании в целях оптимального распределения ресурсов был сделан на сбалансированности полученных результатов с произведенными финансовыми вложениями. Центральной задачей исследования стало формирование авторской эффективной схемы организации процесса управления стимулированием инновационной деятельности на исследуемых предприятиях. Анализ и обсуждение результатов исследований. В результате исследования опыта указанных выше агропромышленных предприятий Республики Татарстан в вопросах управления стимулированием их инновационной деятельности была разработана авторская схема организации процесса управления стимулированием инновационной деятельности, содержание которой отражено на рисунке 1. По рисунку 1 следует пояснить, что весь комплекс реализуемых мероприятий и спрогнозированных ориентиров осуществляется в рамках рассмотрения вариантов использования  собственных и привлеченных трудовых ресурсов предприятия. Базовыми ориентирами разработанной схемы выступают следующие показатели: рентабельность затрат (инвестиций) по чистой прибыли (отношение чистой прибыли к объему затрат (инвестиций), умноженной на сто процентов) за определенный период времени; срок окупаемости затрат (инвестиций) - период времени, в который чистый дисконтированный доход превысит итоговые затраты (инвестиции) по тем или иным мероприятиям в области организации управления стимулированием инновационной деятельности предприятия.