Любая комплексная социально-экономическая система как высшее учебное заведение постоянно находится в некоторой степени несоответствия с предприятием, потребность развиваться, с одной стороны, не соответствует существующей организационной форме и системе управления, с другой. При этом можно сформулировать следующие главные цели при преодолении этого противоречия в социально-экономической системе:• перестройка – больше целого (урегулирование цели);• анализ и улучшение организационной структуры системы;• анализ и улучшение системы управления.Существование структуры – обязательный признак всех реальных систем, так как структура даёт им целостность. Организационная структура – это «состав отражения структуры и иерархия различных элементов, связей и шагов контроля, определённая цель, функционирующая для успеха» [1]. Организационная структура любой системы связана с достижением её цели. Цель – основной фактор интеграции, служащий причиной создания любой системы. В то же время цели социально-экономической системы установлены не с внешней стороны и созданы в системе, и их формирование – одна из задач административного процесса [2].«Поскольку метод комбинации и взаимодействие частей» традиционно представляет организационную структуру социально-экономической системы в единстве следующих позиций [3]: состав, корреляция и подчинение подразделений и услуг, диаграммы линейных и функциональных отношений между подразделениями. На основе влияния на формирование организационного механизма набор коммуникаций в комплексной социально-экономической системе разделён на три группы [4]:1) линейные сцепления воздействия на исполнителей (урегулирование цели, управление, мотивация и обратная связь);2) функциональные коммуникации на выполнение работы подразделениями организации;3) межфункциональные коммуникации для интеграции всей организации в единое целое, координацию его элементов и отношения с окружающей средой.Структура большинства высших учебных заведений России, согласно терминологии теории контроля, является иерархической структурой с линейным и функциональным контролем [5]. При такой структуре разделение труда осуществляется таким образом, что линейные структурные подразделения концентрируют ресурсы и распоряжаются ими, а функциональные – играют вспомогательную роль, а управленческие воздействия на подчинённые структуры осуществляют на основании согласованности действий с вышестоящим руководителем, что отражено на рис. 1.  Рис. 1. Структура управления университетомЛинейно-функциональные блоки, которые являются частью структуры, представляют скорее закрытые вертикально построенные подсистемы, которые взаимодействуют с другими структурными элементами не по горизонтальным, а вертикальным связям, что серьёзно нагружает высший уровень управления. Благодаря этому достигается стабильность и надёжность структуры, а также принимаемых различными уровнями управления решений [6]. Такой подход приводит к увеличению времени, необходимого на принятие решений, происходит более широкое вовлечение руководителей линейных структурных подразделений в текущую деятельность, вследствие чего они вынуждены тратить своё время не на решение своих основных задач, а на «текучку». Эти недостатки могут быть преодолены развитием горизонтальных и кросс-функциональных связей между различными структурными подразделениями, что даёт определённую гибкость линейно-функциональной структуре [7].Долгосрочная практика работы структур такого вида даёт основания полагать, что они являются самыми эффективными при устойчивом режиме, где руководство задействовано в решении однообразных, часто повторяющихся и достаточно постоянно возникающих, задач [8]. Их преимущества ярко выражены в управлении промышленными предприятиями с поточным типом производства, когда сфера деятельности организации плохо восприимчива, чтобы прогрессировать в науке и технике или когда изменения во всех структурных подразделениях происходят медленно и равномерно [9]. Таким образом, когда перед высшим учебным заведением, имеющим иерархическую организационную структуру с линейно-функциональным управлением, возникают нестандартные, а новые серьёзные вызовы, структура показывает своё несовершенство. Ей не хватает адаптивности. «Её способность эффективно выполнить функции множества в определённом ряду изменяющихся условий определена адаптируемостью системы управления» [10].В целом тип систем управления большинством государственных университетов России, существующий в данный момент, согласно классификации теории управления организационными системами, соответствует системе административного рационализма. Вектор действия высшего учебного заведения определён, в первую очередь, рационализацией управления образовательным процессом. Такая система административного рационализма хорошо адаптирована к тактическому управлению высшим учебным заведением. Однако переход к рыночным отношениям, трудное финансовое положение высших учебных заведений сделало их открытыми системами, тесно связанными с внешней социальной и экономической средой, с нестабильными процессами рынка. В мировой практике метод управления открытыми системами в рыночных отношениях, которые характеризуются нестабильностью внешней среды, широко известен как стратегическое управление [6]. Этот метод управления рекомендуется для улучшения системы управления высшими учебными заведениями, потому что:• образовательные и научные циклы обучения студентов охватывают длительный период (от 4 до 10 лет);• образовательные и научные процессы направлены на удовлетворение требований общества в будущем.Конечный продукт стратегического управления – внутренняя структура и организационные изменения на основе использования инновационных методов и моделей, которые обеспечивают чувствительности организации к изменениям во внешнем окружении. Таким образом, главная цель деятельности университета должна заключаться в обеспечении стратегического положения, которое позволит университету быть эффективным в динамически изменяющихся условиях внешней среды [10]. Система управления высшим учебным заведением должна включать две дополнительных подсистемы:1) предоставляющую функционирование эксплуатационным управлением высшего учебного заведения с использованием существующего потенциала, который может быть реализован посредством существующей системы административного рационализма;2) стратегическое управление, направленное на развитие будущей способности высшего учебного заведения, и которое основано на ряде правил и методов, обеспечивающих жизнеспособности высшего учебного заведения в условиях нестабильной внешней среды.В современных социально-экономических условиях выбор стратегии определяет структуру и содержание плана стратегического действия, приоритеты развития организации, концентрацию ресурсов на ключевой деятельности университета в целях фиксации преимуществ организации, преодолевая её недостатки, использование возможностей и данных для сведения к минимуму угроз [10]. Выбор стратегии представляет сконцентрированное выражение интересов и ожиданий не только администрации университета, но также и его способностей, потенциала сотрудников и студентов, потребители научных и образовательных и инновационных услуг, и инновационный компонент играет роль ведущего фактора в управлении университетом, принимая во внимание, что были выполнены выбор и обоснование стратегии его развития на основе прогрессивных подходов к управлению.