В последние годы многие ученые, занимающиеся исследованием общих методологических подходов к квалификации преступлений, не без оснований стали обозначать специальные принципы, характеризующие эту стадию правоприменительной деятельности. Однако определенности относительно количества и содержания соответствующих принципов квалификации преступлений не наблюдается. Кроме того, анализ литературы показывает, что авторы в круг специальных принципов квалификации преступлений включают различные их виды. Единcтво мнений имеет место относительно лишь двух из обозначаемых принципов: точности и полноты квалификации. Очевидно, основой для такого единодушия являются предшествующие исследования авторитетных представителей теории квалификации преступлений, которые хотя и не называли точность и (или) полноту принципами квалификации, но придавали содержательному аспекту этих понятий существенное юридическое значение.Вместе с тем многие авторы наделяют специальным предназначением, свойственным принципу квалификации преступлений, и другие положения. Так, Н. Смирнов и А. Толмачев в качестве самостоятельного принципа квалификации преступлений назвали истинность. А. И. Рарог помимо точности, полноты и истинности квалификации в качестве самостоятельного принципа определяет объективность квалификации преступления. Перечень специальных принципов квалификации преступлений расширяется некоторыми российскими правоведами путем отнесения к ним принципов субъективного вменения, недопустимости двойного вменения, толкования всех сомнений в пользу лица, совершившего преступление. Р. А. Сабитов дополняет перечень еще двумя принципами: «учет общественной опасности квалифицируемого деяния и наказания, установленного за его совершение» и «приоритет норм, смягчающих ответственность виновного».В целом в последнее время в научных публикациях наблюдается тенденция увеличения  количества специальных принципов квалификации. Например, Н. Т. Идрисов приходит к выводу о необходимости выделять следующие специальные принципы квалификации преступлений: персонификация, адекватность, полнота, единообразие, толкование сомнения в пользу обвиняемого. Р. А. Сабитов называет семь принципов. В. А. Навроцкий, рассматривающий квалификацию преступления как одну из разновидностей уголовно-правовой квалификации,  доводит количество таких принципов до девяти: законность; официальность; объективность; точность; индивидуальность; полнота; решение спорных вопросов в пользу лица, деяние которого квалифицируется; недопустимость двойного инкриминирования; стабильность.