<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article
PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.4 20190208//EN"
       "JATS-journalpublishing1.dtd">
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" article-type="research-article" dtd-version="1.4" xml:lang="en">
 <front>
  <journal-meta>
   <journal-id journal-id-type="publisher-id">Acta biomedica scientifica</journal-id>
   <journal-title-group>
    <journal-title xml:lang="en">Acta biomedica scientifica</journal-title>
    <trans-title-group xml:lang="ru">
     <trans-title>Acta biomedica scientifica</trans-title>
    </trans-title-group>
   </journal-title-group>
   <issn publication-format="print">2541-9420</issn>
   <issn publication-format="online">2587-9596</issn>
  </journal-meta>
  <article-meta>
   <article-id pub-id-type="publisher-id">18630</article-id>
   <article-id pub-id-type="doi">10.12737/article_59e8597494f893.97278235</article-id>
   <article-categories>
    <subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru">
     <subject>Микробиология и вирусология</subject>
    </subj-group>
    <subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en">
     <subject>Microbiology and Virology</subject>
    </subj-group>
    <subj-group>
     <subject>Микробиология и вирусология</subject>
    </subj-group>
   </article-categories>
   <title-group>
    <article-title xml:lang="en">CHARACTERISTICS OF CHOLERA STRAINS ISOLATED IN KAZAKHSTAN</article-title>
    <trans-title-group xml:lang="ru">
     <trans-title>ХАРАКТЕРИСТИКА ШТАММОВ ХОЛЕРНЫХ ВИБРИОНОВ,  ВЫДЕЛЕННЫХ НА ТЕРРИТОРИИ КАЗАХСТАНА</trans-title>
    </trans-title-group>
   </title-group>
   <contrib-group content-type="authors">
    <contrib contrib-type="author">
     <name-alternatives>
      <name xml:lang="ru">
       <surname>Утепова</surname>
       <given-names>Ирина Балапановна</given-names>
      </name>
      <name xml:lang="en">
       <surname>Utepova</surname>
       <given-names>Irina Balapanovna</given-names>
      </name>
     </name-alternatives>
     <email>iutepova@kscqzd.kz</email>
    </contrib>
    <contrib contrib-type="author">
     <name-alternatives>
      <name xml:lang="ru">
       <surname>Сагиев</surname>
       <given-names>Заурбек Акимханович</given-names>
      </name>
      <name xml:lang="en">
       <surname>Sagiyev</surname>
       <given-names>Zaurbek Akimhanovich</given-names>
      </name>
     </name-alternatives>
     <email>zaurbeksagiyev@gmail.com</email>
     <bio xml:lang="ru">
      <p>кандидат медицинских наук;</p>
     </bio>
     <bio xml:lang="en">
      <p>candidate of medical sciences;</p>
     </bio>
     <xref ref-type="aff" rid="aff-1"/>
    </contrib>
    <contrib contrib-type="author">
     <name-alternatives>
      <name xml:lang="ru">
       <surname>Алыбаев</surname>
       <given-names>Санжар Досанович</given-names>
      </name>
      <name xml:lang="en">
       <surname>Alybayev</surname>
       <given-names>Sanzhar Dosanovich</given-names>
      </name>
     </name-alternatives>
     <email>salybayev@kscqzd.kz</email>
    </contrib>
    <contrib contrib-type="author">
     <name-alternatives>
      <name xml:lang="ru">
       <surname>Кульбаева</surname>
       <given-names>Мадина Мухаметалиевна</given-names>
      </name>
      <name xml:lang="en">
       <surname>Kulbayeva</surname>
       <given-names>Madina Muhametalievna</given-names>
      </name>
     </name-alternatives>
     <email>mkulbayeva@kscqzd.kz</email>
    </contrib>
    <contrib contrib-type="author">
     <name-alternatives>
      <name xml:lang="ru">
       <surname>Исмаилова</surname>
       <given-names>Акерке Оразалиевна</given-names>
      </name>
      <name xml:lang="en">
       <surname>Ismailova</surname>
       <given-names>Akerke Orazalievna</given-names>
      </name>
     </name-alternatives>
     <email>a.ismailova@kscqzd.kz</email>
    </contrib>
    <contrib contrib-type="author">
     <name-alternatives>
      <name xml:lang="ru">
       <surname>Aбдирасилова</surname>
       <given-names>Айгуль Акзамовна</given-names>
      </name>
      <name xml:lang="en">
       <surname>Abdirassilova</surname>
       <given-names>Aigul Akzamovna</given-names>
      </name>
     </name-alternatives>
     <email>aabdirasilova@kscqzd.kz</email>
    </contrib>
    <contrib contrib-type="author">
     <name-alternatives>
      <name xml:lang="ru">
       <surname>Жунусова</surname>
       <given-names>Айгуль Сагиндыковна</given-names>
      </name>
      <name xml:lang="en">
       <surname>Zhunussova</surname>
       <given-names>Aigul Sagindykovna</given-names>
      </name>
     </name-alternatives>
     <email>azhunussova@kscqzd.kz</email>
    </contrib>
    <contrib contrib-type="author">
     <name-alternatives>
      <name xml:lang="ru">
       <surname>Алдибекова</surname>
       <given-names>Айдана Алдибеккызы</given-names>
      </name>
      <name xml:lang="en">
       <surname>Aldibekova</surname>
       <given-names>Aidana Aldibekkyzy</given-names>
      </name>
     </name-alternatives>
     <email>aidu-aa@mail.ru</email>
    </contrib>
    <contrib contrib-type="author">
     <name-alternatives>
      <name xml:lang="ru">
       <surname>Карымсакова</surname>
       <given-names>Нургуль Темирхановна</given-names>
      </name>
      <name xml:lang="en">
       <surname>Karymsakova</surname>
       <given-names>Nurgul Temirhanovna</given-names>
      </name>
     </name-alternatives>
     <email>n.karymsakova@kscqzd.kz</email>
    </contrib>
    <contrib contrib-type="author">
     <name-alternatives>
      <name xml:lang="ru">
       <surname>Исмакова</surname>
       <given-names>Айжан Маратовна</given-names>
      </name>
      <name xml:lang="en">
       <surname>Ismakova</surname>
       <given-names>Aizhan Maratovna</given-names>
      </name>
     </name-alternatives>
     <email>aismakova@kscqzd.kz</email>
    </contrib>
   </contrib-group>
   <aff-alternatives id="aff-1">
    <aff>
     <institution xml:lang="ru">Казахского научного центра карантинных и зоонозных инфекций им. М. Айкимбаева</institution>
     <city>Алматы</city>
     <country>Россия</country>
    </aff>
    <aff>
     <institution xml:lang="en">M. Aikimbayev Kazakh Scientific Center for Quarantine and Zoonotic Diseases</institution>
     <city>Almaty</city>
     <country>Russian Federation</country>
    </aff>
   </aff-alternatives>
   <volume>2</volume>
   <issue>5P1</issue>
   <fpage>100</fpage>
   <lpage>105</lpage>
   <self-uri xlink:href="http://byulleten.com/ru/2017/11/15/%D1%85%D0%B0%D1%80%D0%B0%D0%BA%D1%82%D0%B5%D1%80%D0%B8%D1%81%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B0-%D1%88%D1%82%D0%B0%D0%BC%D0%BC%D0%BE%D0%B2-%D1%85%D0%BE%D0%BB%D0%B5%D1%80%D0%BD%D1%8B%D1%85-%D0%B2%D0%B8%D0%B1/">http://byulleten.com/ru/2017/11/15/%D1%85%D0%B0%D1%80%D0%B0%D0%BA%D1%82%D0%B5%D1%80%D0%B8%D1%81%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B0-%D1%88%D1%82%D0%B0%D0%BC%D0%BC%D0%BE%D0%B2-%D1%85%D0%BE%D0%BB%D0%B5%D1%80%D0%BD%D1%8B%D1%85-%D0%B2%D0%B8%D0%B1/</self-uri>
   <abstract xml:lang="ru">
    <p>Изучены 34 штамма V.cholerae, выделенных на территории Казахстана в период с 2013 по 2015 годы. Выявлена атипичность водных штаммов V.cholerae O1 по агглютинабельности холерными сыворотками (25%) и отношению к холерным фагам (83,3%), определен уровень антибиотикочувствительности. Преобладающее большинство штаммов V. cholerae (85,3 %) были чувствительными к антибиотикам: ципрофлоксацину, эритромицину, гентамицину, полимиксину, стрептомицину, ампициллину, тетрациклину, доксициклину, левомицетину. &#13;
Молекулярно-генетический метод позволил провести окончательную идентификацию всех культур: было определено, что три слабоагглютинирующиеся изоляты относятся к V. cholerae non О1, а также то, что один штамм, первоначально отнесенный к серогруппе non О1, не относился к виду V. cholerae. В результате была проведена коррекция данных о выделении штаммов (таблица 5). Всего было выделено за исследуемые годы 33 штамма V. cholerae, из них 10 культур О1 серогруппы и 23 non О1 серогруппы.&#13;
Применение ПЦР позволило корректировать фенотипическую идентификацию штаммов, что подтверждает высокую эффективность использования комплексного метода исследования. Комплексный подход с применением молекулярно-генетических методов исследования необходим при исследовании атипичных изолятов холерных вибрионов для своевременного обнаружения холерных вибрионов, проведения противоэпидемических и профилактических мероприятий.</p>
   </abstract>
   <trans-abstract xml:lang="en">
    <p>Изучены 34 штамма V.cholerae, выделенных на территории Казахстана в период с 2013 по 2015 годы. Выявлена атипичность водных штаммов V.cholerae O1 по агглютинабельности холерными сыворотками (25%) и отношению к холерным фагам (83,3%), определен уровень антибиотикочувствительности. Преобладающее большинство штаммов V. cholerae (85,3 %) были чувствительными к антибиотикам: ципрофлоксацину, эритромицину, гентамицину, полимиксину, стрептомицину, ампициллину, тетрациклину, доксициклину, левомицетину. &#13;
Молекулярно-генетический метод позволил провести окончательную идентификацию всех культур: было определено, что три слабоагглютинирующиеся изоляты относятся к V. cholerae non О1, а также то, что один штамм, первоначально отнесенный к серогруппе non О1, не относился к виду V. cholerae. В результате была проведена коррекция данных о выделении штаммов (таблица 5). Всего было выделено за исследуемые годы 33 штамма V. cholerae, из них 10 культур О1 серогруппы и 23 non О1 серогруппы.&#13;
Применение ПЦР позволило корректировать фенотипическую идентификацию штаммов, что подтверждает высокую эффективность использования комплексного метода исследования. Комплексный подход с применением молекулярно-генетических методов исследования необходим при исследовании атипичных изолятов холерных вибрионов для своевременного обнаружения холерных вибрионов, проведения противоэпидемических и профилактических мероприятий.</p>
   </trans-abstract>
   <kwd-group xml:lang="ru">
    <kwd>холерный вибрион</kwd>
    <kwd>агглютинабельность</kwd>
    <kwd>гены</kwd>
    <kwd>антибактериальные препараты</kwd>
    <kwd>штаммы</kwd>
    <kwd>фаги</kwd>
    <kwd>сыворотки</kwd>
   </kwd-group>
  </article-meta>
 </front>
 <body>
  <p></p>
 </body>
 <back>
  <ref-list>
   <ref id="B1">
    <label>1.</label>
    <citation-alternatives>
     <mixed-citation xml:lang="ru">Спислит штаммы холерных вибрионов</mixed-citation>
     <mixed-citation xml:lang="en">Spislit shtammy holernyh vibrionov</mixed-citation>
    </citation-alternatives>
   </ref>
  </ref-list>
 </back>
</article>
