Данная работа посвящена оценке степени уязвимости на территории Сары-Джазского трансграничного природного мезоочага чумы с помощью ГИС-технологий. Данный очаг чумы охватывает большую площадь высокогорных ущелий, сыртов, и мониторинг всей территории очага предполагает большие затраты финансов и труда. Определение районов, которые являются наиболее важными для мониторинга, позволило бы снизить данные затраты. Районы, наиболее важные для ведения постоянного мониторинга, можно определить с помощью оценки уязвимости населения на территории очага. В настоящее время в мировой литературе появляется много работ по оценке уязвимости от тех или иных угроз, но нет определения индексов опасности, риска и уязвимости для очагов чумы. В статье представлены результаты определения этих показателей и вычисляются показатели для каждого сектора природного очага чумы. В результате работы была получена окончательная карта Индекса эпидемиологической уязвимости Сары-Джазского автономного очага чумы. Подробно представлены результаты оценки и окончательная карта для исследуемой области. Авторы надеются, что расчёты и результаты, полученные в ходе этой работы, найдут своё применение как для теоретических оценок уязвимости различных территорий от чумы, так и для практических действий по снижению уязвимости.